Σε μεταπτυχιακό επίπεδο σπουδών ο Τομέας Γεωτεχνικής συμμετέχει σε δύο Διατμηματικά Προγράμματα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΔΠΜΣ) με τη διδασκαλία εξειδικευμένων μαθημάτων στα γνωστικά αντικείμενα του Τομέα. Για την απόκτηση του Μεταπτυχιακού Διπλώματος απαιτείται η εκπόνηση Διπλωματικής Εργασίας. Το πρόγραμμα ολοκληρώνεται σε ένα χρόνο πλέον του χρόνου εκπόνησης της Διπλωματικής Εργασίας.
Τα μεταπτυχιακά προγράμματα παρέχουν το αναγκαίο επιστημονικό υπόβαθρο για τους φοιτητές που επιλέγουν να ακολουθήσουν ερευνητική πορεία σε επίπεδο Διδακτορικής Διατριβής. Στο Εργαστήριο Εδαφομηχανικής εκπονούνται Διαδακτορικές Διατριβές που διαρκούν τρία έως τέσσερα έτη τόσο σε εργαστηριακά όσο και σε αναλυτικά θέματα. Το εργαστήριο διαθέτει υψηλής στάθμης υποδομή και εργαστηριακές συσκευές μοναδικές στην Ελλάδα.